moi je pense que par souci d'équité , tu ne doives pas être payé les heures que tu n'as pas faites, et que tu le sois pour celles que tu as effectuées !
A la place de ton patron (qui a déja été sympa de t'accepter ces congés qui ne font pas parti de ton contrat normalement), c'est ce que je ferais ..
...mais bon suis pas patron , snif ! ;-)